Avec la DCE de 2000, l'Europe démontre que la protection de l'eau et des milieux aquatiques est d'une importance prioritaire en ce début de 21ème siècle.
Si les pollutions domestiques, industrielles et agricoles ont des impacts sur la qualité de l'eau, les travaux d'aménagement, les installation d'ouvrages ou encore l'absence d'entretien sur les cours d'eau ont tout autant d'effets négatifs sur la faune et la flore aquatique.
Sur le bassin du Couesnon, les quatre syndicats de bassin versant portent un CTMA pour palier aux altérations que subissent les cours d'eau (problèmes de régime hydrologique, de morphologie, de continuité écologique ...). Le CTMA est le principal outil opérationnel proposé par l'AELB pour agir sur les cours d'eau.
Voir carte ci-dessous
A l'issue d'une étude préalable, un programme pluriannuel de travaux est élaboré pour corriger les altérations des cours d'eau en vue d'atteindre le bon état écologique des masses d'eau.
Les travaux sont choisis selon les enjeux locaux identifiés dans l'étude préalable. En voici quelques exemples :